二氧化碳培养箱用途广泛，主要用来培养细胞、组织和某些特殊微生物，为它们提供一个良好的体外培养环境，广泛应用于细胞学实验、微生物学实验、组织学实验以及分子生物学实验。因此，它的清洁维护尤为重要。
二氧化碳培养箱的常见污染：
进入二氧化碳培养箱培养环境中，对细胞生存有害的成分和造成细胞不纯的异物都应视为污染。不同的污染物对细胞的影响也有差别，有的影响是长期、缓慢和潜在的，而有的则能在很短的时间内抑制细胞生长或杀死细胞。根据污染源不同主要可以分为：生物性污染、化学性污染、物理性污染和气溶胶污染。
1、生物性污染：
这是常见也是危害较大的污染。如细菌、病毒、真菌，支原体等。这些污染源有可能是人为带入，或是细胞在放入二氧化碳培养箱前已经受污染，再或者是箱体本身没有消毒干净。体外培养的细胞自身没有抵抗污染的能力，而培养基中所加抗生素的抗微生物污染的能力也是有限的，因而细胞微生物污染一旦发生往往是无法挽救的。
2、化学性污染：
设备中许多化学物质都可以引起细胞污染。如细胞培养容器清洗过程中残留的洗涤剂、加湿器中未纯化的水、人为带入的液体或气体都可能成为化学性污染的来源。不同化学物质对细胞污染是不一样的，有的可能促进或抑制细胞生长，有的甚至杀死细胞。
3、物理性污染：
培养环境中的物理因素，如温度、放射线、振动、辐射（紫外线或荧光）会对细胞产生影响。物理性污染常常被人们所忽视，其主要是在代谢水平或分子水平上，影响细胞正常的生理过程。
4、气溶胶污染：
气溶胶是液体或固体微粒均匀地悬浮在气体介质中的分散体系，当微粒是微生物时，就是微生物气溶胶，如果这种微生物是病原性的，就是病原微生物气溶胶。细菌、病毒等病原体通过气溶胶可在人与人、人与环境之间传播。
二氧化碳培养箱污染防控措施：
1、选择：
制造商们设计了多种不同的装置去减少和防止污染的发生，其主要是防污染设计和消毒灭菌系统的改进，以达到消毒灭菌的目的。如带有紫外消毒功能的、带HEPA过滤器净化空气的，以及带高温灭菌的二氧化碳培养箱等，后者又分为高温干热和高温湿热两类。这些装置的灭菌能力各有千秋，紫外灯消毒范围有限，距离灯越远，或者被遮挡，消毒能力越差。
HEPA过滤器的过滤膜孔径有限，无法去除病毒和一些微小细菌，并且容易损耗，也有其局限性。相比而言，高温灭菌则是比较有效的方法。而高温干热和高温湿热也有所不同，不同方法的灭菌效率与温度的高低也有着直接的关系。上海润度生物推出的Herocell系列二氧化碳培养设备可进行140℃的高温干热灭菌，当然也可进行90℃的湿热灭菌，为用户的灭菌方式提供了丰富的可选择性。
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